Das Forschungskonzept der Hochschule gliedert sich in drei Bereiche:
Im Forschungsbereich I wird zurzeit das spannungsvolle Verhältnis von spirituellem Erleben und theologischer Orientierung im Neupietismus (1870-1945) untersucht. Dieser Bereich wird verantwortet von der Forschungsstelle Neupietismus.
Im Forschungsbereich II geht es um theologische, religionspsychologische und psycho-therapeutische Perspektiven zu Spiritualität und Lebensbewältigung, koordiniert durch das Marburger Institut für Religion und Psychotherapie.
Forschungsbereich III umfasst die darüber hinausgehende unabhängige Einzelforschung der Lehrenden.